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| 31.03.2017 | 18:30 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Chemnitzer FC | 0:1 (0:1) | |
| 01.04.2017 | 14:00 | 1. FC Magdeburg | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:0 (0:0) | |
| 14:00 | Werder Bremen II | - | Holstein Kiel | 0:2 (0:1) | ||
| 14:00 | Sportfreunde Lotte | - | VfR Aalen | 0:2 (0:2) | ||
| 14:00 | Fortuna Köln | - | FSV Frankfurt | 0:0 (0:0) | ||
| 14:00 | SC Paderborn 07 | - | SG Sonnenhof Großaspach | 1:2 (1:2) | ||
| 14:00 | MSV Duisburg | - | Jahn Regensburg | 1:1 (1:0) | ||
| 02.04.2017 | 14:00 | SV Wehen Wiesbaden | - | Preußen Münster | 1:0 (0:0) | |
| 14:00 | FSV Zwickau | - | Hallescher FC | 2:0 (1:0) | ||
| 14:00 | VfL Osnabrück | - | Hansa Rostock | 2:1 (1:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
MSV Duisburg | 30 | 14 | 12 | 4 | 36:23 | 13 | 54 |
| 2 |
|
1. FC Magdeburg | 30 | 14 | 8 | 8 | 42:27 | 15 | 50 |
| 3 |
|
VfL Osnabrück | 30 | 14 | 6 | 10 | 42:36 | 6 | 48 |
| 4 |
|
Holstein Kiel | 30 | 12 | 11 | 7 | 44:23 | 21 | 47 |
| 5 |
|
Jahn Regensburg | 30 | 12 | 8 | 10 | 46:40 | 6 | 44 |
| 6 |
|
Chemnitzer FC | 30 | 12 | 7 | 11 | 44:39 | 5 | 43 |
| 7 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 30 | 12 | 7 | 11 | 42:38 | 4 | 43 |
| 8 |
|
FSV Zwickau | 30 | 12 | 7 | 11 | 37:39 | -2 | 43 |
| 9 |
|
Sportfreunde Lotte | 30 | 12 | 6 | 12 | 39:33 | 6 | 42 |
| 10 |
|
Hallescher FC | 30 | 9 | 14 | 7 | 26:25 | 1 | 41 |
| 11 |
|
SV Wehen Wiesbaden | 30 | 11 | 8 | 11 | 32:32 | 0 | 41 |
| 12 |
|
Fortuna Köln | 30 | 10 | 10 | 10 | 29:41 | -12 | 40 |
| 13 |
|
VfR Aalen | 30 | 11 | 14 | 5 | 40:27 | 13 | 38 |
| 14 |
|
Preußen Münster | 30 | 11 | 4 | 15 | 36:38 | -2 | 37 |
| 15 |
|
Hansa Rostock | 30 | 7 | 15 | 8 | 33:34 | -1 | 36 |
| 16 |
|
Rot-Weiß Erfurt | 30 | 10 | 6 | 14 | 24:38 | -14 | 36 |
| 17 |
|
Werder Bremen II | 30 | 10 | 5 | 15 | 24:41 | -17 | 35 |
| 18 |
|
SC Paderborn 07 | 30 | 8 | 5 | 17 | 28:50 | -22 | 29 |
| 19 |
|
1. FSV Mainz 05 II | 30 | 7 | 6 | 17 | 23:44 | -21 | 27 |
| 20 |
|
FSV Frankfurt | 30 | 7 | 11 | 12 | 32:31 | 1 | 23 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Der VfR Aalen ist infolge seines Insolvenzantrags mit einem Abzug von neun Punkten durch den Spielausschuss des DFB belegt worden. # Der FSV Frankfurt ist infolge seines Insolvenzantrags mit einem Abzug von neun Punkten durch den Spielausschuss des DFB belegt worden. |
