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| 22.10.2016 | 17:00 | MFK Zemplín Michalovce | - | 1. FC Tatran Prešov | 2:2 (1:2) | |
| 17:00 | Spartak Myjava | - | FO ŽP Šport Podbrezová | annull. | ||
| 17:00 | MFK Ružomberok | - | MŠK Žilina | 0:2 (0:1) | ||
| 17:00 | Zlaté Moravce | - | Slovan Bratislava | 1:5 (0:3) | ||
| 20:30 | FK Senica | - | AS Trenčín | 1:2 (0:1) | ||
| 23.10.2016 | 17:30 | Spartak Trnava | - | FC DAC 1904 | 1:0 (1:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
MŠK Žilina | 12 | 10 | 1 | 1 | 32:8 | 24 | 31 |
| 2 |
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FO ŽP Šport Podbrezová | 11 | 7 | 3 | 1 | 14:4 | 10 | 24 |
| 3 |
|
Slovan Bratislava | 12 | 7 | 2 | 3 | 22:14 | 8 | 23 |
| 4 |
|
Spartak Trnava | 12 | 5 | 4 | 3 | 15:13 | 2 | 19 |
| 5 |
|
AS Trenčín | 12 | 5 | 2 | 5 | 18:21 | -3 | 17 |
| 6 |
|
MFK Ružomberok | 12 | 4 | 3 | 5 | 23:20 | 3 | 15 |
| 7 |
|
MFK Zemplín Michalovce | 12 | 4 | 3 | 5 | 11:17 | -6 | 15 |
| 8 |
|
FK Senica | 12 | 3 | 2 | 7 | 11:15 | -4 | 11 |
| 9 |
|
1. FC Tatran Prešov | 12 | 2 | 4 | 6 | 7:21 | -14 | 10 |
| 10 |
|
FC DAC 1904 | 12 | 1 | 5 | 6 | 13:21 | -8 | 8 |
| 11 |
|
Zlaté Moravce | 11 | 1 | 3 | 7 | 9:21 | -12 | 6 |
| 12 |
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Spartak Myjava | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Abstieg |
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# Spartak Myjava zog sich im Januar 2017 aufgund finanzieller Probleme aus dem laufenden Wettbewerb zurück. Die absolvierten Spiele wurden annulliert. |
