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| 26.11.2016 | 17:00 | FC DAC 1904 | - | MFK Zemplín Michalovce | 2:1 (1:1) | |
| 17:00 | FO ŽP Šport Podbrezová | - | FK Senica | 2:0 (2:0) | ||
| 17:00 | Zlaté Moravce | - | 1. FC Tatran Prešov | 3:0 (1:0) | ||
| 17:00 | MŠK Žilina | - | Slovan Bratislava | 2:1 (2:1) | ||
| 27.11.2016 | 15:20 | MFK Ružomberok | - | AS Trenčín | 3:3 (1:2) | |
| 17:30 | Spartak Trnava | - | Spartak Myjava | annull. |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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MŠK Žilina | 15 | 12 | 2 | 1 | 42:10 | 32 | 38 |
| 2 |
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FO ŽP Šport Podbrezová | 15 | 10 | 3 | 2 | 21:8 | 13 | 33 |
| 3 |
|
Slovan Bratislava | 16 | 10 | 2 | 4 | 28:17 | 11 | 32 |
| 4 |
|
Spartak Trnava | 15 | 6 | 4 | 5 | 18:22 | -4 | 22 |
| 5 |
|
AS Trenčín | 16 | 6 | 3 | 7 | 24:28 | -4 | 21 |
| 6 |
|
MFK Ružomberok | 15 | 5 | 4 | 6 | 28:25 | 3 | 19 |
| 7 |
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MFK Zemplín Michalovce | 16 | 5 | 4 | 7 | 18:23 | -5 | 19 |
| 8 |
|
FC DAC 1904 | 15 | 3 | 5 | 7 | 17:23 | -6 | 14 |
| 9 |
|
FK Senica | 16 | 3 | 4 | 9 | 12:20 | -8 | 13 |
| 10 |
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Zlaté Moravce | 15 | 3 | 3 | 9 | 16:29 | -13 | 12 |
| 11 |
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1. FC Tatran Prešov | 16 | 2 | 6 | 8 | 9:28 | -19 | 12 |
| 12 |
|
Spartak Myjava | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Abstieg |
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# Spartak Myjava zog sich im Januar 2017 aufgund finanzieller Probleme aus dem laufenden Wettbewerb zurück. Die absolvierten Spiele wurden annulliert. |
