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| 15.04.2017 | 14:30 | FC DAC 1904 | - | AS Trenčín | 1:0 (1:0) | |
| 15:00 | FO ŽP Šport Podbrezová | - | MFK Zemplín Michalovce | 1:4 (0:1) | ||
| 15:00 | Zlaté Moravce | - | FK Senica | 2:1 (1:0) | ||
| 17:00 | MŠK Žilina | - | Spartak Myjava | n.gesp. | ||
| 16.04.2017 | 15:20 | MFK Ružomberok | - | Slovan Bratislava | 2:1 (0:0) | |
| 17:30 | Spartak Trnava | - | 1. FC Tatran Prešov | 4:0 (3:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
MŠK Žilina | 24 | 18 | 4 | 2 | 68:20 | 48 | 58 |
| 2 |
|
Slovan Bratislava | 25 | 15 | 3 | 7 | 43:28 | 15 | 48 |
| 3 |
|
MFK Ružomberok | 24 | 10 | 7 | 7 | 44:33 | 11 | 37 |
| 4 |
|
FO ŽP Šport Podbrezová | 24 | 10 | 7 | 7 | 27:23 | 4 | 37 |
| 5 |
|
AS Trenčín | 25 | 10 | 5 | 10 | 39:40 | -1 | 35 |
| 6 |
|
Spartak Trnava | 25 | 9 | 7 | 9 | 26:29 | -3 | 34 |
| 7 |
|
FC DAC 1904 | 24 | 7 | 10 | 7 | 29:27 | 2 | 31 |
| 8 |
|
MFK Zemplín Michalovce | 25 | 8 | 5 | 12 | 32:45 | -13 | 29 |
| 9 |
|
FK Senica | 25 | 6 | 6 | 13 | 20:28 | -8 | 24 |
| 10 |
|
Zlaté Moravce | 24 | 5 | 6 | 13 | 24:41 | -17 | 21 |
| 11 |
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1. FC Tatran Prešov | 25 | 3 | 8 | 14 | 14:52 | -38 | 17 |
| 12 |
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Spartak Myjava | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Abstieg |
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# Spartak Myjava zog sich im Januar 2017 aufgund finanzieller Probleme aus dem laufenden Wettbewerb zurück. Die absolvierten Spiele wurden annulliert. |
