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| 13.04.2006 | 19:00 | Energie Cottbus | - | Hansa Rostock | 2:0 (1:0) | |
| 19:00 | Sportfreunde Siegen | - | SC Paderborn 07 | 0:2 (0:1) | ||
| 19:00 | Karlsruher SC | - | Kickers Offenbach | 1:1 (0:1) | ||
| 16.04.2006 | 15:00 | LR Ahlen | - | SC Freiburg | 0:0 (0:0) | |
| 15:00 | Wacker Burghausen | - | Eintracht Braunschweig | 1:2 (0:2) | ||
| 15:00 | Erzgebirge Aue | - | TSV 1860 München | 3:0 (2:0) | ||
| 15:00 | SpVgg Unterhaching | - | Dynamo Dresden | 1:1 (0:1) | ||
| 15:00 | 1. FC Saarbrücken | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:0 (1:0) | ||
| 17.04.2006 | 20:15 | Alemannia Aachen | - | VfL Bochum | 0:2 (0:1) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
VfL Bochum | 30 | 18 | 8 | 4 | 51:21 | 30 | 62 |
| 2 |
|
Alemannia Aachen | 30 | 19 | 4 | 7 | 56:31 | 25 | 61 |
| 3 |
|
Energie Cottbus | 30 | 15 | 8 | 7 | 45:29 | 16 | 53 |
| 4 |
|
SpVgg Greuther Fürth | 30 | 13 | 8 | 9 | 46:39 | 7 | 47 |
| 5 |
|
Karlsruher SC | 30 | 13 | 8 | 9 | 43:38 | 5 | 47 |
| 6 |
|
SC Freiburg | 30 | 13 | 7 | 10 | 35:30 | 5 | 46 |
| 7 |
|
Hansa Rostock | 30 | 13 | 4 | 13 | 41:40 | 1 | 43 |
| 8 |
|
Erzgebirge Aue | 30 | 11 | 9 | 10 | 35:33 | 2 | 42 |
| 9 |
|
SC Paderborn 07 | 30 | 11 | 7 | 12 | 39:30 | 9 | 40 |
| 10 |
|
Eintracht Braunschweig | 30 | 12 | 4 | 14 | 34:38 | -4 | 40 |
| 11 |
|
Wacker Burghausen | 30 | 10 | 10 | 10 | 36:44 | -8 | 40 |
| 12 |
|
SpVgg Unterhaching | 30 | 11 | 5 | 14 | 40:41 | -1 | 38 |
| 13 |
|
TSV 1860 München | 30 | 9 | 9 | 12 | 37:40 | -3 | 36 |
| 14 |
|
1. FC Saarbrücken | 30 | 10 | 5 | 15 | 35:56 | -21 | 35 |
| 15 |
|
Kickers Offenbach | 30 | 9 | 7 | 14 | 32:51 | -19 | 34 |
| 16 |
|
Dynamo Dresden | 30 | 8 | 7 | 15 | 31:43 | -12 | 31 |
| 17 |
|
LR Ahlen | 30 | 7 | 8 | 15 | 31:44 | -13 | 29 |
| 18 |
|
Sportfreunde Siegen | 30 | 6 | 6 | 18 | 29:48 | -19 | 24 |
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# Das Spiel Wacker Burghausen - 1860 München (12. Spieltag, 0:2) wird wiederholt. |
