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| 16.11.2012 | 18:00 | 1. FC Kaiserslautern | - | Energie Cottbus | 1:0 (1:0) | |
| 18:00 | Dynamo Dresden | - | FSV Frankfurt | 2:1 (2:0) | ||
| 20:30 | TSV 1860 München | - | 1. FC Köln | 0:2 (0:1) | ||
| 17.11.2012 | 13:00 | Eintracht Braunschweig | - | FC Ingolstadt 04 | 3:0 (1:0) | |
| 13:00 | VfR Aalen | - | SC Paderborn 07 | 0:1 (0:0) | ||
| 18.11.2012 | 13:30 | MSV Duisburg | - | Erzgebirge Aue | 2:1 (1:1) | |
| 13:30 | VfL Bochum | - | SV Sandhausen | 5:2 (3:2) | ||
| 13:30 | Jahn Regensburg | - | 1. FC Union Berlin | 3:3 (2:1) | ||
| 19.11.2012 | 20:15 | Hertha BSC | - | FC St. Pauli | 1:0 (0:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Eintracht Braunschweig | 14 | 10 | 4 | 0 | 25:6 | 19 | 34 |
| 2 |
|
Hertha BSC | 14 | 8 | 5 | 1 | 26:12 | 14 | 29 |
| 3 |
|
1. FC Kaiserslautern | 14 | 7 | 7 | 0 | 27:16 | 11 | 28 |
| 4 |
|
Energie Cottbus | 14 | 7 | 4 | 3 | 20:13 | 7 | 25 |
| 5 |
|
FC Ingolstadt 04 | 14 | 6 | 5 | 3 | 19:16 | 3 | 23 |
| 6 |
|
SC Paderborn 07 | 14 | 6 | 4 | 4 | 21:14 | 7 | 22 |
| 7 |
|
FSV Frankfurt | 14 | 6 | 3 | 5 | 19:17 | 2 | 21 |
| 8 |
|
TSV 1860 München | 14 | 5 | 5 | 4 | 15:12 | 3 | 20 |
| 9 |
|
VfR Aalen | 14 | 6 | 2 | 6 | 15:13 | 2 | 20 |
| 10 |
|
1. FC Union Berlin | 14 | 4 | 5 | 5 | 19:19 | 0 | 17 |
| 11 |
|
1. FC Köln | 14 | 4 | 5 | 5 | 15:17 | -2 | 17 |
| 12 |
|
FC St. Pauli | 14 | 3 | 6 | 5 | 13:17 | -4 | 15 |
| 13 |
|
VfL Bochum | 14 | 3 | 5 | 6 | 14:25 | -11 | 14 |
| 14 |
|
Erzgebirge Aue | 14 | 3 | 4 | 7 | 17:21 | -4 | 13 |
| 15 |
|
Dynamo Dresden | 14 | 3 | 3 | 8 | 16:23 | -7 | 12 |
| 16 |
|
MSV Duisburg | 14 | 3 | 3 | 8 | 11:24 | -13 | 12 |
| 17 |
|
Jahn Regensburg | 14 | 3 | 1 | 10 | 17:25 | -8 | 10 |
| 18 |
|
SV Sandhausen | 14 | 2 | 3 | 9 | 13:32 | -19 | 9 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Am 19.6. wurde endgültig entschieden, dass der MSV Duisburg keine Lizenz für die Zweitligasaison 2013/2014 erhält. Der sportlich abgestiegene SV Sandhausen bleibt damit eine weitere Saison in der 2. Bundesliga. |
