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| 07.12.2012 | 18:00 | 1. FC Union Berlin | - | 1. FC Kaiserslautern | 2:0 (1:0) | |
| 18:00 | VfR Aalen | - | MSV Duisburg | 0:1 (0:0) | ||
| 18:00 | FSV Frankfurt | - | SV Sandhausen | 3:1 (2:0) | ||
| 08.12.2012 | 13:00 | SC Paderborn 07 | - | Hertha BSC | 0:1 (0:0) | |
| 13:00 | Dynamo Dresden | - | VfL Bochum | 0:3 (0:2) | ||
| 09.12.2012 | 13:30 | Jahn Regensburg | - | TSV 1860 München | 1:1 (0:0) | |
| 13:30 | Energie Cottbus | - | FC Ingolstadt 04 | 1:1 (1:0) | ||
| 13:30 | FC St. Pauli | - | Erzgebirge Aue | 0:3 (0:0) | ||
| 10.12.2012 | 20:15 | 1. FC Köln | - | Eintracht Braunschweig | 2:2 (0:1) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Eintracht Braunschweig | 18 | 12 | 5 | 1 | 31:12 | 19 | 41 |
| 2 |
|
Hertha BSC | 18 | 11 | 6 | 1 | 34:14 | 20 | 39 |
| 3 |
|
1. FC Kaiserslautern | 18 | 8 | 8 | 2 | 29:20 | 9 | 32 |
| 4 |
|
Energie Cottbus | 18 | 8 | 5 | 5 | 26:20 | 6 | 29 |
| 5 |
|
1. FC Union Berlin | 18 | 7 | 6 | 5 | 27:23 | 4 | 27 |
| 6 |
|
FSV Frankfurt | 18 | 8 | 3 | 7 | 26:22 | 4 | 27 |
| 7 |
|
TSV 1860 München | 18 | 6 | 8 | 4 | 20:16 | 4 | 26 |
| 8 |
|
VfR Aalen | 18 | 7 | 4 | 7 | 19:16 | 3 | 25 |
| 9 |
|
1. FC Köln | 18 | 6 | 7 | 5 | 22:21 | 1 | 25 |
|
FC Ingolstadt 04 | 18 | 6 | 7 | 5 | 22:21 | 1 | 25 | |
| 11 |
|
SC Paderborn 07 | 18 | 6 | 5 | 7 | 23:20 | 3 | 23 |
| 12 |
|
FC St. Pauli | 18 | 5 | 6 | 7 | 18:22 | -4 | 21 |
| 13 |
|
Erzgebirge Aue | 18 | 5 | 5 | 8 | 24:28 | -4 | 20 |
| 14 |
|
MSV Duisburg | 18 | 5 | 3 | 10 | 16:30 | -14 | 18 |
| 15 |
|
VfL Bochum | 18 | 4 | 5 | 9 | 20:33 | -13 | 17 |
| 16 |
|
Dynamo Dresden | 18 | 3 | 6 | 9 | 18:28 | -10 | 15 |
| 17 |
|
SV Sandhausen | 18 | 3 | 5 | 10 | 20:39 | -19 | 14 |
| 18 |
|
Jahn Regensburg | 18 | 3 | 4 | 11 | 20:30 | -10 | 13 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Am 19.6. wurde endgültig entschieden, dass der MSV Duisburg keine Lizenz für die Zweitligasaison 2013/2014 erhält. Der sportlich abgestiegene SV Sandhausen bleibt damit eine weitere Saison in der 2. Bundesliga. |
