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| H | Pyunik FC | - | CSKA Sofia | 0:2 (0:1) | ||
| R | CSKA Sofia | - | Pyunik FC | 1:0 (0:0) | ||
| H: 30.07.2003 18:00 | R: 06.08.2003 19:30 | Sieger: CSKA Sofia | ||||
| H | Leotar Trebinje | - | Slavia Praha | 1:2 (1:1) | ||
| R | Slavia Praha | - | Leotar Trebinje | 2:0 (1:0) | ||
| H: 30.07.2003 18:00 | R: 06.08.2003 19:00 | Sieger: Slavia Praha | ||||
| H | CSKA Moskva | - | Vardar Skopje | 1:2 (0:0) | ||
| R | Vardar Skopje | - | CSKA Moskva | 1:1 (0:1) | ||
| H: 30.07.2003 18:00 | R: 06.08.2003 18:00 | Sieger: Vardar Skopje | ||||
| H | KF Tiranë | - | Grazer AK | 1:5 (1:3) | ||
| R | Grazer AK | - | KF Tiranë | 2:1 (1:0) | ||
| H: 30.07.2003 18:00 | R: 06.08.2003 20:30 | Sieger: Grazer AK | ||||
| H | FC Sheriff | - | Shakhtar Donetsk | 0:0 (0:0) | ||
| R | Shakhtar Donetsk | - | FC Sheriff | 2:0 (0:0) | ||
| H: 30.07.2003 19:00 | R: 06.08.2003 18:00 | Sieger: Shakhtar Donetsk | ||||
| H | Wisła Kraków | - | Omonia Nikosia | 5:2 (3:0) | ||
| R | Omonia Nikosia | - | Wisła Kraków | 2:2 (1:1) | ||
| H: 30.07.2003 19:00 | R: 06.08.2003 19:00 | Sieger: Wisła Kraków | ||||
| H | Rapid Bucureşti | - | RSC Anderlecht | 0:0 (0:0) | ||
| R | RSC Anderlecht | - | Rapid Bucureşti | 3:2 (0:2) | ||
| H: 30.07.2003 20:00 | R: 06.08.2003 20:30 | Sieger: RSC Anderlecht | ||||
| H | Partizan | - | Djurgårdens IF | 1:1 (0:0) | ||
| R | Djurgårdens IF | - | Partizan | 2:2 (1:0) | ||
| H: 30.07.2003 20:00 | R: 06.08.2003 20:45 | Sieger: Partizan | ||||
| H | MTK Budapest | - | HJK Helsinki | 3:1 (2:0) | ||
| R | HJK Helsinki | - | MTK Budapest | 1:0 (0:0) | ||
| H: 30.07.2003 20:00 | R: 06.08.2003 18:00 | Sieger: MTK Budapest | ||||
| H | FBK Kaunas | - | Celtic FC | 0:4 (0:2) | ||
| R | Celtic FC | - | FBK Kaunas | 1:0 (1:0) | ||
| H: 30.07.2003 20:00 | R: 06.08.2003 20:45 | Sieger: Celtic FC | ||||
| H | FC København | - | Sliema Wanderers | 4:1 (3:0) | ||
| R | Sliema Wanderers | - | FC København | 0:6 (0:3) | ||
| H: 30.07.2003 20:00 | R: 06.08.2003 20:45 | Sieger: FC København | ||||
| H | MŠK Žilina | - | Maccabi Tel Aviv | 1:0 (0:0) | ||
| R | Maccabi Tel Aviv | - | MŠK Žilina | 1:1 (1:1) | ||
| H: 30.07.2003 20:15 | R: 06.08.2003 16:30 | Sieger: MŠK Žilina | ||||
| H | NK Maribor | - | Dinamo Zagreb | 1:1 (1:1) | ||
| R | Dinamo Zagreb | - | NK Maribor | 2:1 (0:1) | ||
| H: 30.07.2003 20:15 | R: 06.08.2003 20:45 | Sieger: Dinamo Zagreb | ||||
| H | Bohemian FC | - | Rosenborg BK | 0:1 (0:1) | ||
| R | Rosenborg BK | - | Bohemian FC | 4:0 (1:0) | ||
| H: 30.07.2003 20:45 | R: 06.08.2003 20:45 | Sieger: Rosenborg BK | ||||
