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| 06.08.2016 | 17:00 | MFK Karviná | - | Zbrojovka Brno | 1:1 (1:1) | |
| 17:00 | FC Hradec Králové | - | FK Jablonec | 1:2 (0:1) | ||
| 17:00 | 1. FC Slovácko | - | FK Dukla Praha | 2:2 (0:1) | ||
| 07.08.2016 | 14:30 | Viktoria Plzeň | - | Bohemians Praha 1905 | 1:1 (1:1) | |
| 17:00 | 1. FK Příbram | - | FK Mladá Boleslav | 0:1 (0:1) | ||
| 17:00 | Slovan Liberec | - | Vysočina Jihlava | 1:1 (1:0) | ||
| 19:00 | FK Teplice | - | AC Sparta Praha | 0:0 (0:0) | ||
| 08.08.2016 | 18:00 | Slavia Praha | - | FC Fastav Zlín | 2:2 (0:2) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FK Mladá Boleslav | 2 | 2 | 0 | 0 | 4:0 | 4 | 6 |
| 2 |
|
FK Jablonec | 2 | 2 | 0 | 0 | 7:4 | 3 | 6 |
| 3 |
|
Slavia Praha | 2 | 1 | 1 | 0 | 6:3 | 3 | 4 |
| 4 |
|
FC Fastav Zlín | 2 | 1 | 1 | 0 | 4:2 | 2 | 4 |
| 5 |
|
AC Sparta Praha | 2 | 1 | 1 | 0 | 3:2 | 1 | 4 |
|
Viktoria Plzeň | 2 | 1 | 1 | 0 | 3:2 | 1 | 4 | |
| 7 |
|
FK Teplice | 2 | 1 | 1 | 0 | 1:0 | 1 | 4 |
| 8 |
|
FC Hradec Králové | 2 | 1 | 0 | 1 | 4:2 | 2 | 3 |
| 9 |
|
1. FC Slovácko | 2 | 0 | 1 | 1 | 4:5 | -1 | 1 |
| 10 |
|
FK Dukla Praha | 2 | 0 | 1 | 1 | 2:3 | -1 | 1 |
|
Vysočina Jihlava | 2 | 0 | 1 | 1 | 2:3 | -1 | 1 | |
| 12 |
|
MFK Karviná | 2 | 0 | 1 | 1 | 4:6 | -2 | 1 |
| 13 |
|
Zbrojovka Brno | 2 | 0 | 1 | 1 | 2:5 | -3 | 1 |
| 14 |
|
Bohemians Praha 1905 | 2 | 0 | 1 | 1 | 1:4 | -3 | 1 |
|
Slovan Liberec | 2 | 0 | 1 | 1 | 1:4 | -3 | 1 | |
| 16 |
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1. FK Příbram | 2 | 0 | 0 | 2 | 0:3 | -3 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Europa League | |
| Abstieg |
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# FC FASTAV Zlín qualifizierte sich als Pokalsieger für die Europa League 2017/2018. |
