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| H | Anzhi Makhachkala | - | Vitesse | 2:0 (0:0) | ||
| R | Vitesse | - | Anzhi Makhachkala | 0:2 (0:0) | ||
| H: 02.08.2012 17:00 | R: 09.08.2012 20:00 | Sieger: Anzhi Makhachkala | ||||
| H | Kuopion PS | - | Bursaspor | 1:0 (0:0) | ||
| R | Bursaspor | - | Kuopion PS | 6:0 (3:0) | ||
| H: 02.08.2012 17:30 | R: 09.08.2012 20:30 | Sieger: Bursaspor | ||||
| H | Dila Gori | - | Anorthosis Famagusta | 0:1 (0:0) | ||
| R | Anorthosis Famagusta | - | Dila Gori | 0:3 (0:0) Wert. | ||
| H: 02.08.2012 18:00 | R: 09.08.2012 | Sieger: Dila Gori | ||||
| H | Arsenal Kiev | - | ND Mura 05 | 0:3 (1:0) Wert. | ||
| R | ND Mura 05 | - | Arsenal Kiev | 0:2 (0:1) | ||
| H: 02.08.2012 18:00 | R: 09.08.2012 20:00 | Sieger: ND Mura 05 | ||||
| H | Ruch Chorzów | - | Viktoria Plzeň | 0:2 (0:0) | ||
| R | Viktoria Plzeň | - | Ruch Chorzów | 5:0 (3:0) | ||
| H: 02.08.2012 19:00 | R: 09.08.2012 20:00 | Sieger: Viktoria Plzeň | ||||
| H | APOEL Nikosia | - | Aalesunds FK | 2:1 (1:1) | ||
| R | Aalesunds FK | - | APOEL Nikosia | 0:1 (0:1) | ||
| H: 02.08.2012 19:00 | R: 09.08.2012 19:00 | Sieger: APOEL Nikosia | ||||
| H | Tromsø IL | - | Metalurh Donetsk | 1:1 (1:0) | ||
| R | Metalurh Donetsk | - | Tromsø IL | 0:1 (0:1) | ||
| H: 02.08.2012 19:00 | R: 09.08.2012 19:00 | Sieger: Tromsø IL | ||||
| H | Bnei Yehuda Tel Aviv | - | PAOK Saloniki | 0:2 (0:0) | ||
| R | PAOK Saloniki | - | Bnei Yehuda Tel Aviv | 4:1 (0:1) | ||
| H: 02.08.2012 19:00 | R: 09.08.2012 20:00 | Sieger: PAOK Saloniki | ||||
| H | AIK Solna | - | Lech Poznań | 3:0 (0:0) | ||
| R | Lech Poznań | - | AIK Solna | 1:0 (0:0) | ||
| H: 02.08.2012 19:00 | R: 09.08.2012 20:00 | Sieger: AIK Solna | ||||
| H | Kalmar FF | - | BSC Young Boys | 1:0 (1:0) | ||
| R | BSC Young Boys | - | Kalmar FF | 3:0 (1:0) | ||
| H: 02.08.2012 19:00 | R: 09.08.2012 19:30 | Sieger: BSC Young Boys | ||||
| H | SV Ried | - | Legia Warszawa | 2:1 (0:0) | ||
| R | Legia Warszawa | - | SV Ried | 3:1 (1:0) | ||
| H: 02.08.2012 19:00 | R: 09.08.2012 19:00 | Sieger: Legia Warszawa | ||||
| H | sc Heerenveen | - | Rapid Bucureşti | 4:0 (1:0) | ||
| R | Rapid Bucureşti | - | sc Heerenveen | 1:0 (1:0) | ||
| H: 02.08.2012 19:30 | R: 09.08.2012 20:30 | Sieger: sc Heerenveen | ||||
| H | FC Twente | - | FK Mladá Boleslav | 2:0 (0:0) | ||
| R | FK Mladá Boleslav | - | FC Twente | 0:2 (0:2) | ||
| H: 02.08.2012 19:45 | R: 09.08.2012 19:00 | Sieger: FC Twente | ||||
| H | FC Steaua Bucureşti | - | Spartak Trnava | 0:1 (0:1) | ||
| R | Spartak Trnava | - | FC Steaua Bucureşti | 0:3 (0:1) | ||
| H: 02.08.2012 19:45 | R: 09.08.2012 19:30 | Sieger: FC Steaua Bucureşti | ||||
| H | Servette FC | - | Rosenborg BK | 1:1 (0:0) | ||
| R | Rosenborg BK | - | Servette FC | 0:0 (0:0) | ||
| H: 02.08.2012 19:45 | R: 09.08.2012 19:00 | Sieger: Rosenborg BK | ||||
| H | KRC Genk | - | FK Aktobe | 2:1 (2:1) | ||
| R | FK Aktobe | - | KRC Genk | 1:2 (1:1) | ||
| H: 02.08.2012 20:00 | R: 09.08.2012 18:00 | Sieger: KRC Genk | ||||
| H | FK Gomel | - | Liverpool FC | 0:1 (0:0) | ||
| R | Liverpool FC | - | FK Gomel | 3:0 (2:0) | ||
| H: 02.08.2012 20:00 | R: 09.08.2012 21:05 | Sieger: Liverpool FC | ||||
| H | Asteras Tripolis | - | CS Marítimo | 1:1 (0:0) | ||
| R | CS Marítimo | - | Asteras Tripolis | 0:0 (0:0) | ||
| H: 02.08.2012 20:00 | R: 09.08.2012 21:00 | Sieger: CS Marítimo | ||||
| H | AC Horsens | - | IF Elfsborg | 1:1 (0:0) | ||
| R | IF Elfsborg | - | AC Horsens | 2:3 (2:3) | ||
| H: 02.08.2012 20:15 | R: 09.08.2012 18:00 | Sieger: AC Horsens | ||||
| H | Videoton FC | - | KAA Gent | 1:0 (0:0) | ||
| R | KAA Gent | - | Videoton FC | 0:3 (0:1) | ||
| H: 02.08.2012 20:30 | R: 09.08.2012 19:30 | Sieger: Videoton FC | ||||
| H | Crvena Zvezda | - | Omonia Nikosia | 0:0 (0:0) | ||
| R | Omonia Nikosia | - | Crvena Zvezda | 5:6 (0:0, 0:0, 0:0) i.E. | ||
| H: 02.08.2012 20:30 | R: 09.08.2012 18:00 | Sieger: Crvena Zvezda | ||||
| H | Hajduk Split | - | Inter | 0:3 (0:2) | ||
| R | Inter | - | Hajduk Split | 0:2 (0:1) | ||
| H: 02.08.2012 20:45 | R: 09.08.2012 20:45 | Sieger: Inter | ||||
| H | Eskişehirspor | - | Olympique Marseille | 1:1 (0:0) | ||
| R | Olympique Marseille | - | Eskişehirspor | 3:0 (2:0) | ||
| H: 02.08.2012 20:45 | R: 09.08.2012 20:45 | Sieger: Olympique Marseille | ||||
| H | Dundee United | - | Dinamo Moskva | 2:2 (1:0) | ||
| R | Dinamo Moskva | - | Dundee United | 5:0 (3:0) | ||
| H: 02.08.2012 20:45 | R: 09.08.2012 18:00 | Sieger: Dinamo Moskva | ||||
| H | St Patrick's Athletic | - | Hannover 96 | 0:3 (0:1) | ||
| R | Hannover 96 | - | St Patrick's Athletic | 2:0 (1:0) | ||
| H: 02.08.2012 20:45 | R: 09.08.2012 20:30 | Sieger: Hannover 96 | ||||
| H | Athletic Bilbao | - | Slaven Belupo | 3:1 (2:1) | ||
| R | Slaven Belupo | - | Athletic Bilbao | 2:1 (1:0) | ||
| H: 02.08.2012 21:00 | R: 09.08.2012 18:45 | Sieger: Athletic Bilbao | ||||
| H | Vojvodina | - | Rapid Wien | 2:1 (0:0) | ||
| R | Rapid Wien | - | Vojvodina | 2:0 (0:0) | ||
| H: 02.08.2012 21:00 | R: 09.08.2012 21:05 | Sieger: Rapid Wien | ||||
| H | FK Sarajevo | - | FK Zeta | 2:1 (2:1) | ||
| R | FK Zeta | - | FK Sarajevo | 1:0 (1:0) | ||
| H: 02.08.2012 21:00 | R: 09.08.2012 20:00 | Sieger: FK Zeta | ||||
| H | FC Admira Wacker | - | AC Sparta Praha | 0:2 (0:1) | ||
| R | AC Sparta Praha | - | FC Admira Wacker | 2:2 (2:1) | ||
| H: 02.08.2012 21:05 | R: 09.08.2012 20:00 | Sieger: AC Sparta Praha | ||||
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# Die Partie zwischen Anorthosis Famagusta gegen Dila Gori wurde wegen Zuschauerausschreitungen abgebrochen und mit 3:0 für Dila Gori gewertet. |
