# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FBK Kaunas, Litauen FBK Kaunas 4 4 0 0 17:0 17 12
2 FK Zalgiris, Litauen FK Zalgiris 4 3 1 0 9:1 8 12
3 Lokomotyvas Kaunas, Litauen Lokomotyvas Kaunas 4 3 0 1 5:2 3 9
4 FK Kareda Siauliai, Litauen FK Kareda Siauliai 4 2 2 0 8:3 5 8
5 FK Atlantas, Litauen FK Atlantas 4 2 1 1 3:1 2 7
6 FK Ekranas, Litauen FK Ekranas 4 2 1 1 11:5 6 6
7 Inkaras Kaunas, Litauen Inkaras Kaunas 3 2 0 1 6:3 3 6
8 FK Banga Gargzdai, Litauen FK Banga Gargzdai 4 1 1 2 1:5 -4 4
9 FK Nevėžis, Litauen FK Nevėžis 3 1 0 2 3:4 -1 3
10 Kauno Jegeriai, Litauen Kauno Jegeriai 3 1 0 2 2:8 -6 3
11 FK Panerys Vilnius, Litauen FK Panerys Vilnius 0 0 0 0 0:0 0 0
12 Mastis Telšiai, Litauen Mastis Telšiai 3 0 0 3 0:3 -3 0
13 FK Žalgiris B, Litauen FK Žalgiris B 4 0 0 4 0:10 -10 0
14 FK Dainava Alytus, Litauen FK Dainava Alytus 4 0 0 4 2:22 -20 0

# Ekranas - Zalgiris (26.05.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Zalgiris gewertet, wobei Zalgiris die drei Punkte zugesporechen wurden (ursprünglich 1:0 für Ekranas)

# Nach dem 6. Spieltag zog Panerys Vilnius sein Team zurück. Alle Partien wurden annulliert.

# Nach dem 13. Spieltag zog Mastis Telsiai seine Mannschaft zurück. Alle bis dahin gespielten Partien behielten ihre Gültigkeit.

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