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| 02.10.1999 | 13:00 | FK Dainava Alytus | - | FK Nevėžis | 0:0 | |
| 13:00 | FK Zalgiris | - | FK Banga Gargždai | 5:0 | ||
| 14:00 | Zalgiris Kaunas | - | Inkaras Kaunas | 1:0 | ||
| 13.10.1999 | 15:00 | Ardena Vilnius | - | FK Ekranas | 0:0 | |
| 03.11.1999 | 12:30 | FK Kareda Siauliai | - | FK Atlantas | 0:0 |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Zalgiris Kaunas | 16 | 11 | 4 | 1 | 28:8 | 20 | 37 |
| 2 |
|
FK Zalgiris | 16 | 8 | 6 | 2 | 28:9 | 19 | 30 |
| 3 |
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FK Atlantas | 16 | 8 | 5 | 3 | 30:21 | 9 | 29 |
| 4 |
|
FK Ekranas | 16 | 7 | 7 | 2 | 20:8 | 12 | 28 |
| 5 |
|
Inkaras Kaunas | 16 | 7 | 4 | 5 | 21:16 | 5 | 25 |
| 6 |
|
FK Kareda Siauliai | 16 | 7 | 3 | 6 | 24:17 | 7 | 24 |
| 7 |
|
FK Nevėžis | 16 | 3 | 7 | 6 | 9:18 | -9 | 16 |
| 8 |
|
FK Banga Gargždai | 16 | 1 | 7 | 8 | 12:30 | -18 | 12 |
| 9 |
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Ardena Vilnius | 16 | 1 | 6 | 9 | 6:22 | -16 | 8 |
| 10 |
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FK Dainava Alytus | 16 | 1 | 3 | 12 | 8:37 | -29 | 6 |
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# Banga - Ardena (03.10.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Banga gewertet, wobei Banga die drei Punkte zugesprochen bekam. |
