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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Zalgiris Kaunas | 9 | 7 | 1 | 1 | 18:5 | 13 | 22 |
| 2 |
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FK Kareda Siauliai | 9 | 5 | 1 | 3 | 16:10 | 6 | 16 |
| 3 |
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FK Zalgiris | 9 | 4 | 3 | 2 | 16:7 | 9 | 15 |
| 4 |
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FK Ekranas | 9 | 4 | 3 | 2 | 11:8 | 3 | 15 |
| 5 |
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FK Atlantas | 9 | 4 | 2 | 3 | 19:15 | 4 | 14 |
| 6 |
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Inkaras Kaunas | 9 | 3 | 4 | 2 | 9:10 | -1 | 13 |
| 7 |
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FK Nevėžis | 9 | 3 | 3 | 3 | 6:9 | -3 | 12 |
| 8 |
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Ardena Vilnius | 9 | 1 | 2 | 6 | 5:13 | -8 | 5 |
| 9 |
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FK Banga Gargždai | 9 | 0 | 5 | 4 | 8:17 | -9 | 5 |
| 10 |
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FK Dainava Alytus | 9 | 1 | 2 | 6 | 5:19 | -14 | 5 |
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# Banga - Ardena (03.10.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Banga gewertet, wobei Banga die drei Punkte zugesprochen bekam. |
