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| 13.09.2012 | 18:00 | FK Šiauliai | - | FK Atlantas | 6:0 | |
| 14.09.2012 | REO Vilnius | - | FK Dainava Alytus | 0:3 Wert. | ||
| 18:00 | VMFD Žalgiris | - | FK Banga Gargždai | 2:0 | ||
| 15.09.2012 | 14:00 | FK Tauras Tauragė | - | FK Kruoja Pakruojis | 0:4 | |
| 16.09.2012 | 15:00 | FK Ekranas | - | FK Sūduva | 2:2 |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FK Ekranas | 28 | 20 | 7 | 1 | 61:21 | 40 | 67 |
| 2 |
|
VMFD Žalgiris | 28 | 19 | 6 | 3 | 56:14 | 42 | 63 |
| 3 |
|
FK Sūduva | 28 | 16 | 6 | 6 | 57:31 | 26 | 54 |
| 4 |
|
FK Kruoja Pakruojis | 28 | 15 | 4 | 9 | 41:25 | 16 | 49 |
| 5 |
|
FK Šiauliai | 28 | 14 | 3 | 11 | 63:42 | 21 | 45 |
| 6 |
|
FK Banga Gargždai | 28 | 9 | 7 | 12 | 27:30 | -3 | 34 |
| 7 |
|
FK Dainava Alytus | 28 | 8 | 4 | 16 | 35:51 | -16 | 28 |
| 8 |
|
FK Tauras Tauragė | 28 | 6 | 2 | 20 | 27:70 | -43 | 20 |
| 9 |
|
REO Vilnius | 28 | 5 | 4 | 19 | 26:57 | -31 | 19 |
| 10 |
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FK Atlantas | 28 | 4 | 5 | 19 | 16:68 | -52 | 17 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Abstieg |
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# REO Vilnius zog sich nach dem 24. Spieltag aus finanziellen Gründen aus dem Spielbetrieb zurück. Alle ausstehenden Spiele wurden mit 0:3 gewertet. |
