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| 09.03.2017 | 20:00 | Bayern München II | - | SpVgg Bayreuth | 1:1 (1:1) | |
| 10.03.2017 | 18:30 | SV Seligenporten | - | FV Illertissen | 0:1 (0:1) | |
| 18:30 | FC Ingolstadt 04 II | - | FC Augsburg II | 0:2 (0:1) | ||
| 11.03.2017 | 14:00 | SpVgg Unterhaching | - | SV Schalding-Heining | 0:0 (0:0) | |
| 14:00 | TSV 1860 Rosenheim | - | FC Memmingen | 0:3 (0:1) | ||
| 14:00 | Wacker Burghausen | - | 1. FC Nürnberg II | 3:1 (1:1) | ||
| 14:00 | TSV Buchbach | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 1:1 (1:1) | ||
| 21.03.2017 | 19:00 | TSV 1860 München II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 3:0 (1:0) | |
| 05.04.2017 | 18:00 | VfR Garching | - | SpVgg Bayern Hof | 2:0 (1:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SpVgg Unterhaching | 23 | 19 | 4 | 0 | 68:11 | 57 | 61 |
| 2 |
|
Bayern München II | 23 | 10 | 9 | 4 | 35:23 | 12 | 39 |
| 3 |
|
FC Augsburg II | 23 | 10 | 8 | 5 | 46:23 | 23 | 38 |
| 4 |
|
Wacker Burghausen | 23 | 11 | 5 | 7 | 36:31 | 5 | 38 |
| 5 |
|
FC Memmingen | 23 | 10 | 6 | 7 | 45:28 | 17 | 36 |
| 6 |
|
1. FC Nürnberg II | 23 | 10 | 5 | 8 | 50:48 | 2 | 35 |
| 7 |
|
FV Illertissen | 23 | 11 | 2 | 10 | 29:32 | -3 | 35 |
| 8 |
|
VfR Garching | 23 | 11 | 2 | 10 | 42:46 | -4 | 35 |
| 9 |
|
1. FC Schweinfurt 05 | 23 | 10 | 4 | 9 | 43:39 | 4 | 34 |
| 10 |
|
SpVgg Bayreuth | 23 | 8 | 6 | 9 | 38:38 | 0 | 30 |
| 11 |
|
TSV 1860 Rosenheim | 23 | 8 | 4 | 11 | 26:34 | -8 | 28 |
| 12 |
|
FC Ingolstadt 04 II | 23 | 6 | 9 | 8 | 31:40 | -9 | 27 |
| 13 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 23 | 6 | 5 | 12 | 26:36 | -10 | 23 |
| 14 |
|
TSV Buchbach | 23 | 6 | 5 | 12 | 27:47 | -20 | 23 |
| 15 |
|
SV Schalding-Heining | 23 | 4 | 9 | 10 | 29:42 | -13 | 21 |
| 16 |
|
SV Seligenporten | 23 | 5 | 4 | 14 | 28:54 | -26 | 19 |
| 17 |
|
SpVgg Bayern Hof | 23 | 2 | 3 | 18 | 24:58 | -34 | 9 |
| 18 |
|
TSV 1860 München II | 23 | 12 | 6 | 5 | 0:0 | -3 | -21 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Der TSV 1860 München II steigt gemäß den Statuten des Verbands automatisch in die Bayernliga ab, da die Profimannschaft des Vereins aus der 2. Bundesliga absteigt. Der SV Seligenporten vermeidet damit den direkten Abstieg und spielt in der Relegation, Schalding-Heining ist gerettet. |
