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| 02.09.2016 | 18:00 | SpVgg Bayern Hof | - | FC Memmingen | 1:3 (0:2) | |
| 18:30 | FV Illertissen | - | TSV Buchbach | 2:2 (1:1) | ||
| 19:00 | SV Seligenporten | - | Wacker Burghausen | 4:3 (3:0) | ||
| 19:00 | Bayern München II | - | TSV 1860 Rosenheim | 2:1 (1:0) | ||
| 19:00 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:2 (1:0) | ||
| 03.09.2016 | 14:00 | SpVgg Greuther Fürth II | - | VfR Garching | 4:2 (4:0) | |
| 14:00 | 1. FC Nürnberg II | - | SpVgg Unterhaching | 1:4 (1:2) | ||
| 14:00 | SV Schalding-Heining | - | SpVgg Bayreuth | 2:3 (2:1) | ||
| 19.10.2016 | 18:00 | FC Augsburg II | - | TSV 1860 München II | 1:0 (0:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SpVgg Unterhaching | 9 | 8 | 1 | 0 | 27:7 | 20 | 25 |
| 2 |
|
Bayern München II | 9 | 5 | 4 | 0 | 16:9 | 7 | 19 |
| 3 |
|
FC Augsburg II | 9 | 4 | 4 | 1 | 23:9 | 14 | 16 |
| 4 |
|
FV Illertissen | 9 | 4 | 2 | 3 | 15:10 | 5 | 14 |
| 5 |
|
1. FC Nürnberg II | 9 | 4 | 2 | 3 | 20:17 | 3 | 14 |
| 6 |
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1. FC Schweinfurt 05 | 9 | 4 | 2 | 3 | 14:17 | -3 | 14 |
| 7 |
|
VfR Garching | 9 | 4 | 1 | 4 | 17:18 | -1 | 13 |
| 8 |
|
FC Memmingen | 9 | 3 | 3 | 3 | 17:12 | 5 | 12 |
| 9 |
|
SpVgg Bayreuth | 9 | 3 | 3 | 3 | 15:17 | -2 | 12 |
| 10 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 9 | 3 | 2 | 4 | 14:12 | 2 | 11 |
| 11 |
|
TSV 1860 Rosenheim | 9 | 3 | 1 | 5 | 6:11 | -5 | 10 |
| 12 |
|
Wacker Burghausen | 9 | 2 | 3 | 4 | 13:18 | -5 | 9 |
| 13 |
|
SV Seligenporten | 9 | 3 | 0 | 6 | 13:32 | -19 | 9 |
| 14 |
|
SV Schalding-Heining | 9 | 1 | 5 | 3 | 13:14 | -1 | 8 |
| 15 |
|
FC Ingolstadt 04 II | 9 | 1 | 5 | 3 | 13:17 | -4 | 8 |
| 16 |
|
TSV Buchbach | 9 | 2 | 2 | 5 | 13:18 | -5 | 8 |
| 17 |
|
SpVgg Bayern Hof | 9 | 1 | 0 | 8 | 12:26 | -14 | 3 |
| 18 |
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TSV 1860 München II | 9 | 5 | 2 | 2 | 0:0 | -7 | -46 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Der TSV 1860 München II steigt gemäß den Statuten des Verbands automatisch in die Bayernliga ab, da die Profimannschaft des Vereins aus der 2. Bundesliga absteigt. Der SV Seligenporten vermeidet damit den direkten Abstieg und spielt in der Relegation, Schalding-Heining ist gerettet. |
