# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 21 14 5 2 46:16 30 47
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 21 12 5 4 39:25 14 41
3 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 21 10 5 6 37:33 4 35
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 21 8 10 3 38:28 10 34
5 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 21 10 4 7 28:23 5 34
6 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 21 9 6 6 25:24 1 33
7 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 21 8 7 6 27:20 7 31
8 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 21 8 6 7 36:29 7 30
9 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 21 6 8 7 31:33 -2 26
10 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 21 7 5 9 30:38 -8 26
11 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 21 7 4 10 27:30 -3 25
12 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 21 6 5 10 28:27 1 23
13 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 21 6 4 11 25:33 -8 22
  VfR Garching, Deutschland VfR Garching 21 5 7 9 25:33 -8 22
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 21 6 4 11 18:37 -19 22
16 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 21 4 7 10 31:43 -12 19
17 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 21 5 4 12 31:47 -16 19
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 21 8 4 9 28:31 -3 -17
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.

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