# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 23 16 5 2 53:17 36 53
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 23 13 6 4 43:27 16 45
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 9 11 3 40:29 11 38
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 23 10 7 6 31:21 10 37
5 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 23 10 6 7 39:36 3 36
6 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 23 10 5 8 29:26 3 35
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 23 9 7 7 37:29 8 34
8 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 23 9 6 8 27:32 -5 33
9 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 23 8 5 10 32:40 -8 29
10 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 23 7 7 9 29:33 -4 28
11 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 23 7 6 10 29:32 -3 27
12 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 23 6 9 8 33:37 -4 27
13 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 23 7 5 11 31:30 1 26
14 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 23 7 4 12 27:35 -8 25
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 23 6 5 12 20:40 -20 23
16 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 23 4 8 11 33:47 -14 20
17 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 23 5 5 13 32:49 -17 20
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 23 8 5 10 29:34 -5 -16
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.

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