# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 28 19 5 4 61:25 36 62
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 28 18 6 4 58:32 26 60
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 28 14 7 7 41:27 14 49
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 28 11 12 5 44:34 10 45
5 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 28 12 7 9 48:45 3 43
6 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 28 12 6 10 37:33 4 42
7 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 28 11 6 11 43:38 5 39
8 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 28 11 5 12 44:49 -5 38
9 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 28 10 7 11 41:36 5 37
10 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 28 9 8 11 38:41 -3 35
11 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 28 9 7 12 30:42 -12 34
12 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 28 9 6 13 39:39 0 33
13 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 28 7 10 11 40:49 -9 31
14 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 28 8 5 15 32:44 -12 29
15 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 28 8 5 15 40:53 -13 29
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 28 7 6 15 26:49 -23 27
17 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 28 6 8 14 40:60 -20 26
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 28 9 8 11 37:43 -6 -10
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.

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