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| 26.04.2017 | 17:20 | Spartak Trnava | - | Slovan Bratislava | 0:3 (0:1) | |
| 19:00 | Spartak Myjava | - | 1. FC Tatran Prešov | n.gesp. | ||
| 19:00 | FO ŽP Šport Podbrezová | - | Zlaté Moravce | 2:0 (1:0) | ||
| 19:00 | MFK Ružomberok | - | MFK Zemplín Michalovce | 3:1 (2:0) | ||
| 27.04.2017 | 18:00 | FC DAC 1904 | - | FK Senica | 1:0 (0:0) | |
| 28.04.2017 | 18:00 | AS Trenčín | - | MŠK Žilina | 2:1 (1:1) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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MŠK Žilina | 26 | 19 | 4 | 3 | 70:22 | 48 | 61 |
| 2 |
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Slovan Bratislava | 27 | 16 | 3 | 8 | 46:29 | 17 | 51 |
| 3 |
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FO ŽP Šport Podbrezová | 26 | 11 | 8 | 7 | 30:24 | 6 | 41 |
| 4 |
|
AS Trenčín | 27 | 12 | 5 | 10 | 43:42 | 1 | 41 |
| 5 |
|
MFK Ružomberok | 26 | 11 | 7 | 8 | 48:36 | 12 | 40 |
| 6 |
|
FC DAC 1904 | 26 | 9 | 10 | 7 | 32:28 | 4 | 37 |
| 7 |
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Spartak Trnava | 26 | 9 | 7 | 10 | 26:32 | -6 | 34 |
| 8 |
|
MFK Zemplín Michalovce | 27 | 8 | 5 | 14 | 34:50 | -16 | 29 |
| 9 |
|
FK Senica | 27 | 6 | 7 | 14 | 21:30 | -9 | 25 |
| 10 |
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Zlaté Moravce | 26 | 5 | 7 | 14 | 25:44 | -19 | 22 |
| 11 |
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1. FC Tatran Prešov | 26 | 3 | 9 | 14 | 15:53 | -38 | 18 |
| 12 |
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Spartak Myjava | 0 | 0 | 0 | 0 | 0:0 | 0 | 0 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Abstieg |
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# Spartak Myjava zog sich im Januar 2017 aufgund finanzieller Probleme aus dem laufenden Wettbewerb zurück. Die absolvierten Spiele wurden annulliert. |
