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| H | WIT Georgia | - | Austria Wien | n.gesp. | ||
| R | Austria Wien | - | WIT Georgia | 2:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 | R: 28.08.2008 19:30 | Sieger: Austria Wien | ||||
| H | FK Liepājas Metalurgs | - | FC Vaslui | 0:2 (0:0) | ||
| R | FC Vaslui | - | FK Liepājas Metalurgs | 3:1 (3:0) | ||
| H: 14.08.2008 17:00 | R: 28.08.2008 19:30 | Sieger: FC Vaslui | ||||
| H | Borac Čačak | - | Lokomotiv Sofia | 1:0 (0:0) | ||
| R | Lokomotiv Sofia | - | Borac Čačak | 1:1 (1:1) | ||
| H: 14.08.2008 17:15 | R: 26.08.2008 19:00 | Sieger: Borac Čačak | ||||
| H | Vojvodina | - | Hapoel Tel Aviv | 0:0 (0:0) | ||
| R | Hapoel Tel Aviv | - | Vojvodina | 3:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 17:30 | R: 28.08.2008 18:00 | Sieger: Hapoel Tel Aviv | ||||
| H | FC Honka | - | Viking FK | 0:0 (0:0) | ||
| R | Viking FK | - | FC Honka | 1:2 (1:1) | ||
| H: 14.08.2008 17:30 | R: 28.08.2008 18:30 | Sieger: FC Honka | ||||
| H | Legia Warszawa | - | FK Moskva | 1:2 (0:0) | ||
| R | FK Moskva | - | Legia Warszawa | 2:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 18:00 | R: 28.08.2008 16:00 | Sieger: FK Moskva | ||||
| H | Haka Valkeakoski | - | Brøndby IF | 0:4 (0:1) | ||
| R | Brøndby IF | - | Haka Valkeakoski | 2:0 (2:0) | ||
| H: 14.08.2008 18:00 | R: 28.08.2008 19:30 | Sieger: Brøndby IF | ||||
| H | VfB Stuttgart | - | Győri ETO FC | 2:1 (2:1) | ||
| R | Győri ETO FC | - | VfB Stuttgart | 1:4 (0:2) | ||
| H: 14.08.2008 18:30 | R: 28.08.2008 20:30 | Sieger: VfB Stuttgart | ||||
| H | PFC Litex Lovech | - | Ironi Kiryat Shmona | 0:0 (0:0) | ||
| R | Ironi Kiryat Shmona | - | PFC Litex Lovech | 1:2 (1:1) | ||
| H: 14.08.2008 19:00 | R: 28.08.2008 18:00 | Sieger: PFC Litex Lovech | ||||
| H | APOEL Nikosia | - | Crvena Zvezda | 2:2 (1:1) | ||
| R | Crvena Zvezda | - | APOEL Nikosia | 3:3 (0:0, 2:2) n.V. | ||
| H: 14.08.2008 19:00 | R: 28.08.2008 20:15 | Sieger: APOEL Nikosia | ||||
| H | FK Sūduva | - | RB Salzburg | 1:4 (1:1) | ||
| R | RB Salzburg | - | FK Sūduva | 0:1 (0:0) | ||
| H: 14.08.2008 19:00 | R: 28.08.2008 18:30 | Sieger: RB Salzburg | ||||
| H | Djurgårdens IF | - | Rosenborg BK | 2:1 (1:0) | ||
| R | Rosenborg BK | - | Djurgårdens IF | 5:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 19:00 | R: 28.08.2008 19:00 | Sieger: Rosenborg BK | ||||
| H | Stabæk IF | - | Stade Rennais | 2:1 (1:0) | ||
| R | Stade Rennais | - | Stabæk IF | 2:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 19:00 | R: 28.08.2008 20:30 | Sieger: Stade Rennais | ||||
| H | IF Elfsborg | - | St Patrick's Athletic | 2:2 (2:0) | ||
| R | St Patrick's Athletic | - | IF Elfsborg | 2:1 (0:0) | ||
| H: 14.08.2008 19:00 | R: 28.08.2008 20:45 | Sieger: St Patrick's Athletic | ||||
| H | BSC Young Boys | - | Debreceni VSC | 4:1 (1:1) | ||
| R | Debreceni VSC | - | BSC Young Boys | 2:3 (1:1) | ||
| H: 14.08.2008 19:30 | R: 28.08.2008 20:00 | Sieger: BSC Young Boys | ||||
| H | Aris Saloniki | - | Slaven Belupo | 1:0 (0:0) | ||
| R | Slaven Belupo | - | Aris Saloniki | 2:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:00 | R: 28.08.2008 18:30 | Sieger: Slaven Belupo | ||||
| H | Slovan Liberec | - | MŠK Žilina | 1:2 (0:1) | ||
| R | MŠK Žilina | - | Slovan Liberec | 2:1 (0:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:00 | R: 28.08.2008 19:30 | Sieger: MŠK Žilina | ||||
| H | Dnipro Dnipropetrovsk | - | AC Bellinzona | 3:2 (1:0) | ||
| R | AC Bellinzona | - | Dnipro Dnipropetrovsk | 2:1 (1:1) | ||
| H: 14.08.2008 20:00 | R: 28.08.2008 20:15 | Sieger: AC Bellinzona | ||||
| H | KAA Gent | - | Kalmar FF | 2:1 (0:0) | ||
| R | Kalmar FF | - | KAA Gent | 4:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:00 | R: 28.08.2008 19:00 | Sieger: Kalmar FF | ||||
| H | FC København | - | Lillestrøm SK | 3:1 (1:0) | ||
| R | Lillestrøm SK | - | FC København | 2:4 (1:2) | ||
| H: 14.08.2008 20:00 | R: 28.08.2008 19:00 | Sieger: FC København | ||||
| H | FH Hafnarfjörður | - | Aston Villa | 1:4 (1:3) | ||
| R | Aston Villa | - | FH Hafnarfjörður | 1:1 (1:1) | ||
| H: 14.08.2008 20:00 | R: 28.08.2008 21:00 | Sieger: Aston Villa | ||||
| H | Maccabi Netanya | - | Cherno More Varna | 1:1 (1:1) | ||
| R | Cherno More Varna | - | Maccabi Netanya | 2:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:10 | R: 28.08.2008 19:00 | Sieger: Cherno More Varna | ||||
| H | FC Zürich | - | Sturm Graz | 1:1 (1:0) | ||
| R | Sturm Graz | - | FC Zürich | 2:4 (1:1, 1:1, 1:1) i.E. | ||
| H: 14.08.2008 20:15 | R: 28.08.2008 19:30 | Sieger: FC Zürich | ||||
| H | Široki Brijeg | - | Beşiktaş | 1:2 (0:1) | ||
| R | Beşiktaş | - | Široki Brijeg | 4:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:30 | R: 28.08.2008 20:00 | Sieger: Beşiktaş | ||||
| H | FK Vllaznia | - | SSC Napoli | 0:3 (0:1) | ||
| R | SSC Napoli | - | FK Vllaznia | 5:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:30 | R: 28.08.2008 21:00 | Sieger: SSC Napoli | ||||
| H | AEK Athen | - | Omonia Nikosia | 0:1 (0:1) | ||
| R | Omonia Nikosia | - | AEK Athen | 2:2 (1:1) | ||
| H: 14.08.2008 20:30 | R: 28.08.2008 19:00 | Sieger: Omonia Nikosia | ||||
| H | Sporting Braga | - | Zrinjski Mostar | 1:0 (0:0) | ||
| R | Zrinjski Mostar | - | Sporting Braga | 0:2 (0:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:45 | R: 28.08.2008 18:15 | Sieger: Sporting Braga | ||||
| H | Lech Poznań | - | Grasshopper Club Zürich | 6:0 (2:0) | ||
| R | Grasshopper Club Zürich | - | Lech Poznań | 0:0 (0:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:45 | R: 28.08.2008 20:00 | Sieger: Lech Poznań | ||||
| H | Interblock Ljubljana | - | Hertha BSC | 0:2 (0:1) | ||
| R | Hertha BSC | - | Interblock Ljubljana | 1:0 (1:0) | ||
| H: 14.08.2008 20:45 | R: 28.08.2008 18:30 | Sieger: Hertha BSC | ||||
| H | Manchester City | - | FC Midtjylland | 0:1 (0:1) | ||
| R | FC Midtjylland | - | Manchester City | 2:4 (0:0, 0:1, 0:1) i.E. | ||
| H: 14.08.2008 20:45 | R: 28.08.2008 16:25 | Sieger: Manchester City | ||||
| H | Queen Of The South | - | FC Nordsjælland | 1:2 (1:2) | ||
| R | FC Nordsjælland | - | Queen Of The South | 2:1 (0:1) | ||
| H: 14.08.2008 20:45 | R: 26.08.2008 19:00 | Sieger: FC Nordsjælland | ||||
| H | Deportivo La Coruña | - | Hajduk Split | 0:0 (0:0) | ||
| R | Hajduk Split | - | Deportivo La Coruña | 0:2 (0:1) | ||
| H: 14.08.2008 21:00 | R: 28.08.2008 20:45 | Sieger: Deportivo La Coruña | ||||
