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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Slovan Bratislava | 5 | 4 | 1 | 0 | 12:5 | 7 | 13 |
| 2 |
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FC Nitra | 5 | 4 | 1 | 0 | 6:1 | 5 | 13 |
| 3 |
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Spartak Trnava | 5 | 4 | 0 | 1 | 7:4 | 3 | 12 |
| 4 |
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FC DAC 1904 | 5 | 3 | 2 | 0 | 7:3 | 4 | 11 |
| 5 |
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MFK Ružomberok | 5 | 3 | 1 | 1 | 10:6 | 4 | 10 |
| 6 |
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MŠK Žilina | 4 | 3 | 0 | 1 | 17:6 | 11 | 9 |
| 7 |
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Zlaté Moravce | 4 | 3 | 0 | 1 | 10:5 | 5 | 9 |
| 8 |
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MFK Zemplín Michalovce | 3 | 2 | 0 | 1 | 4:2 | 2 | 6 |
| 9 |
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Železiarne Podbrezová | 5 | 2 | 0 | 3 | 7:9 | -2 | 6 |
| 10 |
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AS Trenčín | 5 | 1 | 2 | 2 | 7:8 | -1 | 5 |
| 11 |
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FK Senica | 4 | 0 | 1 | 3 | 2:5 | -3 | 1 |
| 12 |
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1. FC Tatran Prešov | 4 | 0 | 1 | 3 | 3:13 | -10 | 1 |
| Playoffs | |
| Relegation |
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# Spartak Myjava zog sich im Januar 2017 aufgund finanzieller Probleme aus dem laufenden Wettbewerb zurück. In der Saison 2017/2018 sollte eigentlich VSS Košic nachrücken, ging aber ebenfalls pleite. Daher tritt nun der FC Nitra an. |
