| 13. Spieltag | 19.10.2013 | FK Krasnodar | - | FK Tom Tomsk | 4:0 | ||||
| 18. Spieltag | 02.12.2013 | Anzhi Makhachkala | - | FK Tom Tomsk | 0:2 | ||||
| 19. Spieltag | 08.12.2013 | Terek Grozny | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 17.03.2014 | FK Tom Tomsk | - | FK Krasnodar | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 19.04.2014 | FK Tom Tomsk | - | Krylia Sovetov | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 11.05.2014 | CSKA Moskva | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 15.05.2014 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 3:2 |
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