| 1. Spieltag | 11.07.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Neftekhimik | 0:1 | ||||
| 2. Spieltag | 16.07.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | Dinamo Moskva | 0:0 | ||||
| 4. Spieltag | 27.07.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | Zenit St. Petersburg 2 | 0:3 | ||||
| 5. Spieltag | 31.07.2016 | Volgar Astrakhan | - | Enisey Krasnoyarsk | 0:0 | ||||
| 6. Spieltag | 06.08.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | Spartak Nalchik | 0:1 | ||||
| 7. Spieltag | 13.08.2016 | Luch-Energiya Vladivostok | - | Enisey Krasnoyarsk | 0:2 | ||||
| 8. Spieltag | 17.08.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | Spartak Moskva 2 | 0:4 | ||||
| 9. Spieltag | 21.08.2016 | FK Tosno | - | Enisey Krasnoyarsk | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 17.09.2016 | Sibir Novosibirsk | - | Enisey Krasnoyarsk | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 26.09.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | Mordovia Saransk | 4:0 | ||||
| 22. Spieltag | 13.11.2016 | Zenit St. Petersburg 2 | - | Enisey Krasnoyarsk | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 19.11.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | Volgar Astrakhan | 1:0 |
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