| 11. Spieltag | 15.10.2006 | VfB Stuttgart II | - | Karlsruher SC II | 0:0 |  |
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| 12. Spieltag | 20.10.2006 | 1. FC Kaiserslautern II | - | VfB Stuttgart II | 0:2 | ||||
| 13. Spieltag | 29.10.2006 | Bayern München II | - | VfB Stuttgart II | 4:1 | ||||
| 14. Spieltag | 03.11.2006 | VfB Stuttgart II | - | FC Ingolstadt 04 | 0:1 | ||||
| 15. Spieltag | 08.11.2006 | SV Darmstadt 98 | - | VfB Stuttgart II | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 17.11.2006 | 1. FC Saarbrücken | - | VfB Stuttgart II | 3:2 | |
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| 18. Spieltag | 24.11.2006 | Sportfreunde Siegen | - | VfB Stuttgart II | 1:2 | |
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| 19. Spieltag | 02.12.2006 | VfB Stuttgart II | - | SSV Reutlingen | 0:1 | ||||
| 20. Spieltag | 09.12.2006 | FK Pirmasens | - | VfB Stuttgart II | 0:1 | ||||
| 22. Spieltag | 03.03.2007 | SV Wehen-Taunusstein | - | VfB Stuttgart II | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 11.03.2007 | VfB Stuttgart II | - | TSV 1860 München II | 0:0 |
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