| 2. Spieltag | 30.08.2009 | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 05.10.2009 | Panathinaikos | - | AE Lárissa | 4:0 | ||||
| 7. Spieltag | 18.10.2009 | AO Kavala | - | Panathinaikos | 2:2 | ||||
| 8. Spieltag | 25.10.2009 | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 01.11.2009 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 22.11.2009 | Panathinaikos | - | Asteras Tripolis | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 06.12.2009 | Panathinaikos | - | Atromitos | 3:1 |  |
|||
| 14. Spieltag | 12.12.2009 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| 25. Spieltag | 07.03.2010 | Panathinaikos | - | Levadiakos | 3:0 | ||||
| 27. Spieltag | 21.03.2010 | Panathinaikos | - | Olympiakos Piraeus | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 18.04.2010 | PAS Giannina | - | Panathinaikos | 0:1 |
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