| 5. Spieltag | 20.08.2012 | Krylia Sovetov | - | FK Amkar Perm | 0:2 | ||||
| 6. Spieltag | 26.08.2012 | FK Amkar Perm | - | FK Krasnodar | 2:2 |  |
|||
| 7. Spieltag | 01.09.2012 | Spartak Vladikavkaz | - | FK Amkar Perm | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 07.10.2012 | Rubin Kazan | - | FK Amkar Perm | 0:1 | ||||
| 12. Spieltag | 21.10.2012 | FK Amkar Perm | - | Terek Grozny | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 26.10.2012 | Lokomotiv Moskva | - | FK Amkar Perm | 1:2 | ||||
| 14. Spieltag | 03.11.2012 | FK Amkar Perm | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:3 | ||||
| 15. Spieltag | 09.11.2012 | FK Rostov | - | FK Amkar Perm | 3:0 | ||||
| 16. Spieltag | 18.11.2012 | CSKA Moskva | - | FK Amkar Perm | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 27.04.2013 | Terek Grozny | - | FK Amkar Perm | 2:1 |
Usbekistan