| 1. Spieltag | 07.08.1999 | KVC Westerlo | - | KRC Genk | 6:6 |  |
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| 2. Spieltag | 14.08.1999 | KAA Gent | - | KRC Genk | 0:2 | ||||
| 3. Spieltag | 21.08.1999 | Verbroedering Geel | - | KRC Genk | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 29.08.1999 | KRC Genk | - | Standard Liège | 4:0 | ||||
| 5. Spieltag | 11.09.1999 | RSC Charleroi | - | KRC Genk | 2:1 | |
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| 6. Spieltag | 18.09.1999 | KRC Genk | - | Excelsior Mouscron | 2:2 | |
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| 7. Spieltag | 25.09.1999 | KSK Beveren | - | KRC Genk | 1:4 | |
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| 8. Spieltag | 03.10.1999 | KRC Genk | - | Lierse SK (old) | 2:2 | |
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| 9. Spieltag | 13.10.1999 | Lommelse SK | - | KRC Genk | 0:1 | ||||
| 10. Spieltag | 24.10.1999 | KRC Genk | - | Club Brugge KV | 1:0 | |
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| 12. Spieltag | 06.11.1999 | KRC Genk | - | Sporting Lokeren | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 10.11.1999 | KRC Genk | - | Germinal Beerschot | 4:0 | |
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| 14. Spieltag | 20.11.1999 | KRC Genk | - | K.S.C. Eendracht Aalst | 2:1 | ||||
| 15. Spieltag | 28.11.1999 | RSC Anderlecht | - | KRC Genk | 1:3 | |
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| 17. Spieltag | 11.12.1999 | KV Mechelen | - | KRC Genk | 2:0 |  |
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