| 18. Spieltag | 20.01.2013 | Fortuna Düsseldorf | - | FC Augsburg | 2:3 | ||||
| 19. Spieltag | 26.01.2013 | FC Augsburg | - | FC Schalke 04 | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 02.02.2013 | VfL Wolfsburg | - | FC Augsburg | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 10.02.2013 | FC Augsburg | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 16.02.2013 | Bayer Leverkusen | - | FC Augsburg | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 23.02.2013 | FC Augsburg | - | 1899 Hoffenheim | 2:1 |  |
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| 24. Spieltag | 02.03.2013 | Werder Bremen | - | FC Augsburg | 0:1 |  |
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| 25. Spieltag | 08.03.2013 | FC Augsburg | - | 1. FC Nürnberg | 1:2 | ||||
| 26. Spieltag | 16.03.2013 | Hamburger SV | - | FC Augsburg | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 30.03.2013 | FC Augsburg | - | Hannover 96 | 0:2 | ||||
| 28. Spieltag | 06.04.2013 | Borussia Dortmund | - | FC Augsburg | 4:2 | ||||
| 29. Spieltag | 14.04.2013 | FC Augsburg | - | Eintracht Frankfurt | 2:0 | |
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| 30. Spieltag | 19.04.2013 | Bor. Mönchengladbach | - | FC Augsburg | 1:0 | ||||
| 31. Spieltag | 27.04.2013 | FC Augsburg | - | VfB Stuttgart | 3:0 | |
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| 32. Spieltag | 05.05.2013 | SC Freiburg | - | FC Augsburg | 2:0 | ||||
| 33. Spieltag | 11.05.2013 | Bayern München | - | FC Augsburg | 3:0 | ||||
| 34. Spieltag | 18.05.2013 | FC Augsburg | - | SpVgg Greuther Fürth | 3:1 | |
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