| 6. Spieltag | 07.09.2003 | CF Pachuca | - | Puebla FC | 0:2 | ||||
| 7. Spieltag | 14.09.2003 | Puebla FC | - | Monarcas Morelia | 4:2 |  |
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| 8. Spieltag | 21.09.2003 | Gallos Blancos (old) | - | Puebla FC | 0:2 | ||||
| 9. Spieltag | 24.09.2003 | Puebla FC | - | UANL Tigres | 0:1 | |
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| 10. Spieltag | 28.09.2003 | Deportivo Toluca | - | Puebla FC | 0:0 | |
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| 11. Spieltag | 05.10.2003 | Puebla FC | - | Deportivo Guadalajara | 1:1 |  |
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| 13. Spieltag | 19.10.2003 | Club Irapuato | - | Puebla FC | 3:1 | ||||
| 14. Spieltag | 22.10.2003 | Puebla FC | - | Pumas UNAM | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 25.10.2003 | Cruz Azul | - | Puebla FC | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 02.11.2003 | Puebla FC | - | Veracruz (old) | 3:4 | ||||
| 17. Spieltag | 09.11.2003 | UAG Tecos | - | Puebla FC | 2:1 | ||||
| 19. Spieltag | 22.11.2003 | CF América | - | Puebla FC | 4:1 |
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