| 20. Spieltag | 24.11.2012 | Stevenage FC | - | Tranmere Rovers | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 08.12.2012 | Tranmere Rovers | - | Portsmouth FC | 2:2 | ||||
| 22. Spieltag | 15.12.2012 | Sheffield United | - | Tranmere Rovers | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 21.12.2012 | Swindon Town | - | Tranmere Rovers | 5:0 | ||||
| 34. Spieltag | 23.02.2013 | Colchester United | - | Tranmere Rovers | 1:5 | ||||
| 35. Spieltag | 26.02.2013 | Tranmere Rovers | - | Notts County | 1:1 | ||||
| 36. Spieltag | 02.03.2013 | Yeovil Town | - | Tranmere Rovers | 1:0 |  |
|||
| 37. Spieltag | 09.03.2013 | Tranmere Rovers | - | Oldham Athletic | 1:0 | |
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| 38. Spieltag | 12.03.2013 | Walsall FC | - | Tranmere Rovers | 2:0 | ||||
| 43. Spieltag | 06.04.2013 | Doncaster Rovers | - | Tranmere Rovers | 1:0 |
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