| 18. Spieltag | 17.01.2009 | Sporting Lokeren | - | SV Zulte Waregem | 2:1 | ||||
| 19. Spieltag | 25.01.2009 | SV Zulte Waregem | - | Club Brugge KV | 3:1 | ||||
| 20. Spieltag | 31.01.2009 | SV Zulte Waregem | - | KV Mechelen | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 07.02.2009 | KRC Genk | - | SV Zulte Waregem | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 14.02.2009 | SV Zulte Waregem | - | FCV Dender EH | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 21.02.2009 | AFC Tubize | - | SV Zulte Waregem | 0:6 | ||||
| 24. Spieltag | 28.02.2009 | SV Zulte Waregem | - | KVC Westerlo | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 07.03.2009 | RSC Anderlecht | - | SV Zulte Waregem | 2:0 | ||||
| 27. Spieltag | 22.03.2009 | KAA Gent | - | SV Zulte Waregem | 1:0 | ||||
| 28. Spieltag | 04.04.2009 | SV Zulte Waregem | - | Cercle Brugge | 3:1 | ||||
| 29. Spieltag | 11.04.2009 | Germinal Beerschot | - | SV Zulte Waregem | 1:2 |  |
|||
| 30. Spieltag | 18.04.2009 | SV Zulte Waregem | - | KV Kortrijk | 5:1 | ||||
| 31. Spieltag | 25.04.2009 | Sporting Charleroi | - | SV Zulte Waregem | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 02.05.2009 | SV Zulte Waregem | - | Standard Liège | 0:0 |  |
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| 34. Spieltag | 16.05.2009 | SV Zulte Waregem | - | RAEC Mons | 3:0 |
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