| 4. Spieltag | 04.04.2008 | FK Moskva | - | FK Khimki | 2:2 | ||||
| 5. Spieltag | 12.04.2008 | FK Amkar Perm | - | FK Moskva | 2:0 | ||||
| 10. Spieltag | 10.05.2008 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Moskva | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 15.05.2008 | FK Moskva | - | Krylia Sovetov | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 09.07.2008 | FK Saturn | - | FK Moskva | 0:0 | ||||
| 13. Spieltag | 13.07.2008 | FK Moskva | - | Terek Grozny | 0:0 | ||||
| 17. Spieltag | 09.08.2008 | FK Moskva | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 17.08.2008 | FK Khimki | - | FK Moskva | 0:2 | ||||
| 19. Spieltag | 24.08.2008 | FK Moskva | - | FK Amkar Perm | 0:1 | ||||
| 20. Spieltag | 31.08.2008 | Dinamo Moskva | - | FK Moskva | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 13.09.2008 | FK Moskva | - | Spartak Moskva | 2:1 |  |
|||
| 24. Spieltag | 05.10.2008 | FK Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 2:1 | |
|||
| 26. Spieltag | 26.10.2008 | FK Moskva | - | FK Saturn | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 02.11.2008 | Terek Grozny | - | FK Moskva | 1:1 | |
|||
| 29. Spieltag | 16.11.2008 | Lokomotiv Moskva | - | FK Moskva | 3:2 | ||||
| 30. Spieltag | 22.11.2008 | FK Moskva | - | Luch-Energiya Vladivostok | 3:0 |
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