| 17. Spieltag | 03.03.2025 | FC Zlín | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | ||||
| 18. Spieltag | 07.03.2025 | 1. SK Prostějov | - | Viktoria Žižkov | 2:1 | ||||
| 19. Spieltag | 14.03.2025 | FC Sellier & Bellot Vlašim | - | 1. SK Prostějov | 3:1 | ||||
| 20. Spieltag | 28.03.2025 | 1. SK Prostějov | - | Baník Ostrava B | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 04.04.2025 | Vysočina Jihlava | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 03.05.2025 | 1. SK Prostějov | - | AC Sparta Praha B | 1:2 |  |
|||
| 27. Spieltag | 07.05.2025 | MFK Chrudim | - | 1. SK Prostějov | 1:3 | ||||
| 28. Spieltag | 11.05.2025 | 1. SK Prostějov | - | SK Líšeň | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 17.05.2025 | FK MAS Táborsko | - | 1. SK Prostějov | 1:0 |
Tschechien