| 16. Spieltag | 04.01.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | AE Lárissa | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 08.02.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | OFI Heraklion | 1:2 |  |
|||
| 22. Spieltag | 14.02.2009 | AEK Athen | - | Thrasyvoulos Fylis | 1:0 | |
|||
| 23. Spieltag | 22.02.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | Panthrakikos | 0:2 | ||||
| 24. Spieltag | 28.02.2009 | Aris Saloniki | - | Thrasyvoulos Fylis | 2:1 | |
|||
| 25. Spieltag | 08.03.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | Ergotelis | 1:3 | ||||
| 27. Spieltag | 22.03.2009 | PAOK Saloniki | - | Thrasyvoulos Fylis | 2:1 | |
|||
| 28. Spieltag | 05.04.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | Iraklis Saloniki | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 26.04.2009 | Thrasyvoulos Fylis | - | Olympiakos Piraeus | 0:2 |
Kosovo