| 4. Spieltag | 04.04.2021 | Tulevik Viljandi | - | FCI Levadia | 0:4 |  |
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| 6. Spieltag | 11.04.2021 | FCI Levadia | - | JK Nõmme Kalju | 1:0 | |
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| 7. Spieltag | 18.04.2021 | FCI Levadia | - | Paide Linnameeskond | 0:4 | ||||
| 8. Spieltag | 21.04.2021 | FCI Levadia | - | JK Narva Trans | 3:2 | ||||
| 9. Spieltag | 25.04.2021 | FC Flora | - | FCI Levadia | 0:0 | |
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| 10. Spieltag | 02.05.2021 | JK Tammeka | - | FCI Levadia | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 05.05.2021 | FCI Levadia | - | Tulevik Viljandi | 4:1 | |
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| 13. Spieltag | 15.05.2021 | Pärnu JK Vaprus | - | FCI Levadia | 0:4 | ||||
| 14. Spieltag | 19.05.2021 | FCI Levadia | - | FC Flora | 2:4 | ||||
| 16. Spieltag | 29.05.2021 | Tallinna JK Legion | - | FCI Levadia | 2:3 | |
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| 1. Spieltag | 26.06.2021 | FCI Levadia | - | FC Kuressaare | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 01.07.2021 | FCI Levadia | - | JK Tammeka | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 01.08.2021 | JK Narva Trans | - | FCI Levadia | 1:4 | |
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| 21. Spieltag | 01.12.2021 | FCI Levadia | - | FC Flora | 1:5 |
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