| 21. Spieltag | 30.01.2013 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:1 | ||||
| 24. Spieltag | 02.02.2013 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfL Osnabrück | 2:1 | ||||
| 25. Spieltag | 09.02.2013 | Arminia Bielefeld | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 02.03.2013 | Rot-Weiß Erfurt | - | 1. FC Saarbrücken | 1:2 | ||||
| 30. Spieltag | 10.04.2013 | Rot-Weiß Erfurt | - | Karlsruher SC | 0:1 |  |
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| 26. Spieltag | 16.04.2013 | Rot-Weiß Erfurt | - | Alemannia Aachen | 3:1 |  |
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| 35. Spieltag | 27.04.2013 | Rot-Weiß Erfurt | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 37. Spieltag | 11.05.2013 | Rot-Weiß Erfurt | - | SV Darmstadt 98 | 2:4 |
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