| 12. Spieltag | 21.11.1999 | MSV Duisburg | - | TSV 1860 München | 3:0 | ||||
| 13. Spieltag | 28.11.1999 | Borussia Dortmund | - | MSV Duisburg | 2:2 | ||||
| 14. Spieltag | 03.12.1999 | MSV Duisburg | - | Hansa Rostock | 2:2 | ||||
| 15. Spieltag | 10.12.1999 | Arminia Bielefeld | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 26. Spieltag | 25.03.2000 | MSV Duisburg | - | VfL Wolfsburg | 2:3 |  |
|||
| 27. Spieltag | 31.03.2000 | SSV Ulm 1846 | - | MSV Duisburg | 0:3 | ||||
| 28. Spieltag | 09.04.2000 | MSV Duisburg | - | SC Freiburg | 1:2 | ||||
| 29. Spieltag | 12.04.2000 | TSV 1860 München | - | MSV Duisburg | 4:1 | ||||
| 30. Spieltag | 15.04.2000 | MSV Duisburg | - | Borussia Dortmund | 2:2 | ||||
| 31. Spieltag | 22.04.2000 | Hansa Rostock | - | MSV Duisburg | 3:1 | ||||
| 32. Spieltag | 27.04.2000 | MSV Duisburg | - | Arminia Bielefeld | 0:3 | ||||
| 34. Spieltag | 20.05.2000 | MSV Duisburg | - | Hamburger SV | 1:1 |
Tschechien