| 1. Spieltag | 02.08.1998 | SFC Opava | - | FC Boby-sport Brno | 2:1 | ||||
| 2. Spieltag | 09.08.1998 | FC Boby-sport Brno | - | Slovan Liberec | 0:2 | ||||
| 3. Spieltag | 22.08.1998 | Slavia Praha | - | FC Boby-sport Brno | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 30.08.1998 | FC Boby-sport Brno | - | FK Teplice | 0:3 |  |
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| 8. Spieltag | 05.10.1998 | Sigma Olomouc | - | FC Boby-sport Brno | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 25.10.1998 | FK Jablonec 97 | - | FC Boby-sport Brno | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 08.03.1999 | FC Boby-sport Brno | - | Slavia Praha | 1:0 | |
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| 20. Spieltag | 20.03.1999 | FC Boby-sport Brno | - | Chmel Blsany | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 04.04.1999 | FC Dukla Pribram | - | FC Boby-sport Brno | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 11.04.1999 | FC Boby-sport Brno | - | Baník Ostrava | 3:0 | ||||
| 24. Spieltag | 25.04.1999 | Viktoria Žižkov | - | FC Boby-sport Brno | 0:2 | ||||
| 26. Spieltag | 09.05.1999 | AC Sparta Praha | - | FC Boby-sport Brno | 4:1 | |
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| 28. Spieltag | 16.05.1999 | Viktoria Plzeň | - | FC Boby-sport Brno | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 22.05.1999 | FC Boby-sport Brno | - | FC Karviná | 4:2 |
Tschechien