| 1. Spieltag | 02.08.2024 | FC Zlínsko | - | FC Zlín B | 3:0 | ||||
| 2. Spieltag | 11.08.2024 | FC Zlín B | - | SK Uničov | 3:1 | ||||
| 3. Spieltag | 17.08.2024 | FC Strání | - | FC Zlín B | 1:2 |  |
|||
| 4. Spieltag | 25.08.2024 | FC Zlín B | - | Hanácká Slávia Kroměříž | 0:2 | ||||
| 5. Spieltag | 31.08.2024 | TJ Unie Hlubina | - | FC Zlín B | 0:5 | ||||
| 6. Spieltag | 07.09.2024 | FC Zlín B | - | FK Třinec | 3:1 | ||||
| 17. Spieltag | 11.09.2024 | FC Zlín B | - | ČSK Uherský Brod | 0:1 | ||||
| 8. Spieltag | 21.09.2024 | FC Zlín B | - | 1. FC Slovácko B | 2:0 | ||||
| 19. Spieltag | 02.04.2025 | SK Uničov | - | FC Zlín B | 2:1 | ||||
| 22. Spieltag | 05.04.2025 | FC Zlín B | - | TJ Unie Hlubina | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 12.04.2025 | FK Třinec | - | FC Zlín B | 4:0 | |
|||
| 24. Spieltag | 18.04.2025 | FC Zlín B | - | FK Hodonín | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 30.04.2025 | FC Zlín B | - | FK Blansko | 4:2 | ||||
| 27. Spieltag | 10.05.2025 | FC Slovan Rosice | - | FC Zlín B | 3:1 | ||||
| 28. Spieltag | 17.05.2025 | FC Zlín B | - | TJ Start Brno | 2:3 | ||||
| 29. Spieltag | 24.05.2025 | FC Hlučín | - | FC Zlín B | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 31.05.2025 | FC Zlín B | - | MFK Karviná B | 3:2 | |
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