| 1. Spieltag | 08.02.2009 | Atlético Junior | - | Millonarios | 2:1 | ||||
| 2. Spieltag | 15.02.2009 | Cúcuta Deportivo | - | Atlético Junior | 0:0 | ||||
| 3. Spieltag | 19.02.2009 | Atlético Junior | - | Atlético Nacional | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 01.03.2009 | Atlético Junior | - | Deportivo Pasto | 2:0 | ||||
| 6. Spieltag | 08.03.2009 | Deportivo Cali | - | Atlético Junior | 2:1 |  |
|||
| 7. Spieltag | 15.03.2009 | Atlético Junior | - | Real Cartagena | 0:2 | ||||
| 10. Spieltag | 05.04.2009 | Atlético Junior | - | Santa Fe | 3:1 | ||||
| 13. Spieltag | 26.04.2009 | Deportivo Pereira | - | Atlético Junior | 1:3 |  |
|||
| 15. Spieltag | 03.05.2009 | América de Cali | - | Atlético Junior | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.05.2009 | Atlético Junior | - | Deportes Quindío | 4:1 | ||||
| 18. Spieltag | 17.05.2009 | Deportes Tolima | - | Atlético Junior | 1:0 |
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