| 3. Spieltag | 20.01.2013 | UANL Tigres | - | Atlas Guadalajara | 1:0 |  |
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| 4. Spieltag | 27.01.2013 | Atlas Guadalajara | - | CF América | 2:1 |  |
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| 5. Spieltag | 02.02.2013 | Jaguares Chiapas | - | Atlas Guadalajara | 1:2 | ||||
| 6. Spieltag | 10.02.2013 | Atlas Guadalajara | - | Atlante | 2:1 | |
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| 7. Spieltag | 17.02.2013 | Atlas Guadalajara | - | CF Monterrey | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 24.02.2013 | Gallos Blancos (old) | - | Atlas Guadalajara | 0:0 | |
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| 9. Spieltag | 03.03.2013 | Atlas Guadalajara | - | Club Tijuana | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 10.03.2013 | Deportivo Toluca | - | Atlas Guadalajara | 0:1 | |
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| 11. Spieltag | 17.03.2013 | Atlas Guadalajara | - | Santos Laguna | 1:2 | ||||
| 12. Spieltag | 31.03.2013 | Cruz Azul | - | Atlas Guadalajara | 1:2 | |
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| 13. Spieltag | 07.04.2013 | Atlas Guadalajara | - | Monarcas Morelia | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 14.04.2013 | Club San Luis | - | Atlas Guadalajara | 2:2 | ||||
| 15. Spieltag | 21.04.2013 | Atlas Guadalajara | - | Deportivo Guadalajara | 1:0 | |
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| 16. Spieltag | 28.04.2013 | Puebla FC | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | ||||
| 17. Spieltag | 05.05.2013 | Atlas Guadalajara | - | Club León | 0:1 | |
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