| 2. Spieltag | 14.04.2024 | FK Orel | - | FK Khimki 2 | 1:2 |  |
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| 3. Spieltag | 21.04.2024 | FK Khimki 2 | - | SKA-Khabarovsk 2 | 1:0 | |
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| 9. Spieltag | 01.06.2024 | Spartak Tambov | - | FK Khimki 2 | 2:3 | ||||
| 10. Spieltag | 07.06.2024 | FK Khimki 2 | - | Zenit Penza | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 19.06.2024 | FK Sakhalin | - | FK Khimki 2 | 2:0 | ||||
| 17. Spieltag | 04.08.2024 | SKA-Khabarovsk 2 | - | FK Khimki 2 | 0:5 | |
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| 20. Spieltag | 24.08.2024 | FK Khimki 2 | - | Dinamo Vladivostok | 0:2 | |
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| 23. Spieltag | 15.09.2024 | FK Khimki 2 | - | Spartak Tambov | 0:3 | ||||
| 24. Spieltag | 22.09.2024 | Zenit Penza | - | FK Khimki 2 | 3:2 | ||||
| 25. Spieltag | 29.09.2024 | FK Khimki 2 | - | Arsenal Tula 2 | 2:2 | ||||
| 26. Spieltag | 06.10.2024 | FK Khimki 2 | - | FK Sakhalin | 1:0 | |
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| 27. Spieltag | 13.10.2024 | FK Khimki 2 | - | FK Kolomna | 3:1 | |
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| 28. Spieltag | 20.10.2024 | Kosmos Dolgoprudny | - | FK Khimki 2 | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 28.10.2024 | FK Khimki 2 | - | FK Ryazan | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 03.11.2024 | Salyut Belgorod | - | FK Khimki 2 | 1:2 |
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