| 17. Spieltag | 03.03.2025 | FC Zlín | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | ||||
| 18. Spieltag | 09.03.2025 | Sigma Olomouc B | - | FC Zlín | 1:2 | ||||
| 19. Spieltag | 16.03.2025 | Viktoria Žižkov | - | FC Zlín | 1:3 | ||||
| 20. Spieltag | 28.03.2025 | FC Zlín | - | FC Sellier & Bellot Vlašim | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 07.05.2025 | SFC Opava | - | FC Zlín | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 11.05.2025 | FC Zlín | - | MFK Vyškov | 2:1 | ||||
| 29. Spieltag | 17.05.2025 | MFK Chrudim | - | FC Zlín | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 25.05.2025 | FC Zlín | - | SK Líšeň | 2:1 |
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