| 1. Spieltag | 02.08.2024 | FC Zlínsko | - | FC Zlín B | 3:0 | ||||
| 2. Spieltag | 11.08.2024 | FC Zlín B | - | SK Uničov | 3:1 |  |
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| 3. Spieltag | 17.08.2024 | FC Strání | - | FC Zlín B | 1:2 | ||||
| 4. Spieltag | 25.08.2024 | FC Zlín B | - | Hanácká Slávia Kroměříž | 0:2 | ||||
| 5. Spieltag | 31.08.2024 | TJ Unie Hlubina | - | FC Zlín B | 0:5 | ||||
| 6. Spieltag | 07.09.2024 | FC Zlín B | - | FK Třinec | 3:1 | ||||
| 17. Spieltag | 11.09.2024 | FC Zlín B | - | ČSK Uherský Brod | 0:1 | ||||
| 8. Spieltag | 21.09.2024 | FC Zlín B | - | 1. FC Slovácko B | 2:0 | |
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| 9. Spieltag | 29.09.2024 | FK Frýdek-Místek | - | FC Zlín B | 2:1 |  |
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| 13. Spieltag | 27.10.2024 | MFK Karviná B | - | FC Zlín B | 1:2 | ||||
| 14. Spieltag | 02.11.2024 | 1. SC Znojmo | - | FC Zlín B | 3:1 | ||||
| 15. Spieltag | 09.11.2024 | FC Zlín B | - | FC Zbrojovka Brno B | 2:1 | ||||
| 16. Spieltag | 16.11.2024 | FK Blansko | - | FC Zlín B | 2:4 | ||||
| 20. Spieltag | 22.03.2025 | FC Zlín B | - | FC Strání | 3:1 | ||||
| 21. Spieltag | 29.03.2025 | Hanácká Slávia Kroměříž | - | FC Zlín B | 5:0 | ||||
| 25. Spieltag | 27.04.2025 | 1. FC Slovácko B | - | FC Zlín B | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 04.05.2025 | FC Zlín B | - | FK Frýdek-Místek | 4:4 |
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