| 25. Spieltag | 12.03.2016 | FK Kamaz | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 0:2 |  |
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| 26. Spieltag | 16.03.2016 | SKA-Energiya Khabarovsk | - | Spartak Moskva 2 | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 20.03.2016 | Fakel Voronezh | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 27.03.2016 | SKA-Energiya Khabarovsk | - | FK Radian-Baikal Irkutsk | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 03.04.2016 | Zenit St. Petersburg 2 | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 0:0 | |
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| 31. Spieltag | 11.04.2016 | FK Tosno | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 3:2 |  |
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| 32. Spieltag | 18.04.2016 | SKA-Energiya Khabarovsk | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 25.04.2016 | Gazovik Orenburg | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 0:0 | ||||
| 34. Spieltag | 02.05.2016 | SKA-Energiya Khabarovsk | - | Shinnik Yaroslavl | 2:2 | ||||
| 35. Spieltag | 06.05.2016 | Volgar Astrakhan | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 10.05.2016 | SKA-Energiya Khabarovsk | - | Enisey Krasnoyarsk | 0:2 | ||||
| 37. Spieltag | 15.05.2016 | FK Tyumen | - | SKA-Energiya Khabarovsk | 0:2 | ||||
| 38. Spieltag | 21.05.2016 | SKA-Energiya Khabarovsk | - | Luch-Energiya Vladivostok | 2:0 | |
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