| 1. Spieltag | 02.03.2013 | Oita Trinita | - | FC Tokyo | 1:2 | ||||
| 2. Spieltag | 09.03.2013 | FC Tokyo | - | Kashiwa Reysol | 3:0 | ||||
| 3. Spieltag | 16.03.2013 | Cerezo Osaka | - | FC Tokyo | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 30.03.2013 | Yokohama F. Marinos | - | FC Tokyo | 3:2 |  |
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| 5. Spieltag | 06.04.2013 | FC Tokyo | - | RB Omiya Ardija | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 13.04.2013 | Vegalta Sendai | - | FC Tokyo | 2:1 | |
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| 7. Spieltag | 20.04.2013 | FC Tokyo | - | Nagoya Grampus | 3:1 | ||||
| 8. Spieltag | 27.04.2013 | FC Tokyo | - | Kawasaki Frontale | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 03.05.2013 | Sagan Tosu | - | FC Tokyo | 2:3 | ||||
| 10. Spieltag | 06.05.2013 | FC Tokyo | - | Júbilo Iwata | 2:2 | |
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| 11. Spieltag | 11.05.2013 | Shonan Bellmare | - | FC Tokyo | 3:2 | ||||
| 12. Spieltag | 18.05.2013 | FC Tokyo | - | Shimizu S-Pulse | 2:0 | ||||
| 13. Spieltag | 25.05.2013 | Kashima Antlers | - | FC Tokyo | 3:2 | |
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