| 31. Spieltag | 20.11.2011 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 3:1 |  |
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| 34. Spieltag | 12.03.2012 | FK Tom Tomsk | - | Volga Nizhniy Novgorod | 1:0 |  |
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| 36. Spieltag | 24.03.2012 | FK Tom Tomsk | - | Krylia Sovetov | 0:0 | ||||
| 37. Spieltag | 30.03.2012 | Spartak Nalchik | - | FK Tom Tomsk | 0:2 | |
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| 38. Spieltag | 08.04.2012 | FK Krasnodar | - | FK Tom Tomsk | 3:1 | |
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| 41. Spieltag | 27.04.2012 | FK Tom Tomsk | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 42. Spieltag | 03.05.2012 | Krylia Sovetov | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 43. Spieltag | 07.05.2012 | FK Tom Tomsk | - | Spartak Nalchik | 1:1 | ||||
| 44. Spieltag | 13.05.2012 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 2:1 | |
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