| 1. Spieltag | 05.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | JK Sillamäe Kalev | 2:0 | ||||
| 2. Spieltag | 09.03.2016 | FC Infonet | - | JK Nõmme Kalju | 2:1 | ||||
| 3. Spieltag | 12.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Rakvere JK Tarvas | 3:1 | ||||
| 10. Spieltag | 30.04.2016 | Paide Linnameeskond | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 17.05.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Pärnu Linnameeskond | 3:0 |  |
|||
| 14. Spieltag | 24.05.2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Levadia | 0:1 | ||||
| 16. Spieltag | 19.06.2016 | JK Sillamäe Kalev | - | JK Nõmme Kalju | 1:3 | ||||
| 18. Spieltag | 10.07.2016 | Rakvere JK Tarvas | - | JK Nõmme Kalju | 1:6 | ||||
| 20. Spieltag | 24.07.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Pärnu Linnameeskond | 0:0 | ||||
| 32. Spieltag | 01.10.2016 | JK Nõmme Kalju | - | JK Sillamäe Kalev | 3:1 |
Estland