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| H | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 0:0 | ||
| R | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 0:1 | ||
| H: 28.02.2007 18:00 | R: 18.04.2007 15:00 | Sieger: Panathinaikos | ||||
| H | AE Lárissa | - | PAS Giannina | 2:0 | ||
| R | PAS Giannina | - | AE Lárissa | 0:2 | ||
| H: 14.03.2007 18:00 | R: 18.04.2007 18:00 | Sieger: AE Lárissa | ||||
